Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vti1bO88384 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vti1bO88384 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms