Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnnt1O88346 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt1O88346 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms