Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1bO70237 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms