Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms