Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngr1O55100 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms