Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Copb2O55029 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb2O55029 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Copb2O55029 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Copb2O55029 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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