Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SlkO54988 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SlkO54988 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SlkO54988 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SlkO54988 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SlkO54988 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SlkO54988 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SlkO54988 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SlkO54988 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SlkO54988 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SlkO54988 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SlkO54988 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SlkO54988 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SlkO54988 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SlkO54988 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SlkO54988 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SlkO54988 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SlkO54988 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SlkO54988 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SlkO54988 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SlkO54988 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SlkO54988 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SlkO54988 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlkO54988 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms