Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms