Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsksO54887 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsksO54887 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsksO54887 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsksO54887 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsksO54887 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsksO54887 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsksO54887 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsksO54887 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsksO54887 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsksO54887 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TsksO54887 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TsksO54887 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TsksO54887 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsksO54887 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms