Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms