Protein–RNA interactions for Protein: O54743

Foxf2, Forkhead box protein F2, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf2O54743 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf2O54743 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf2O54743 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms