Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf9O35739 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf9O35739 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf9O35739 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf9O35739 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms