Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms