Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TnxbO35452 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TnxbO35452 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TnxbO35452 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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