Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf5O35445 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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