Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms