Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna4O35343 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms