Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms