Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f3O35261 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f3O35261 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f3O35261 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f3O35261 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f3O35261 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f3O35261 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f3O35261 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f3O35261 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f3O35261 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms