Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms