Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc23O35125 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms