Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms