Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms