Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms