Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MttpO08601 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MttpO08601 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MttpO08601 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MttpO08601 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MttpO08601 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MttpO08601 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MttpO08601 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MttpO08601 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MttpO08601 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MttpO08601 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MttpO08601 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MttpO08601 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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