Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna4O08542 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms