Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms