Protein–RNA interactions for Protein: L7N476

Gm9611, Predicted gene 9611 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9611L7N476 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9611L7N476 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9611L7N476 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms