Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms