Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4312K9J7E2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4312K9J7E2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms