Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms