Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8888J3QPX5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8888J3QPX5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms