Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms