Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gm19965J3QNY8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Gm19965J3QNY8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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Gm19965J3QNY8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Gm19965J3QNY8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gm19965J3QNY8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gm19965J3QNY8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gm19965J3QNY8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gm19965J3QNY8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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Gm19965J3QNY8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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