Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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