Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc180J3QNE4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc180J3QNE4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms