Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW1

Gm7137, MCG1044197, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7137J3QMW1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm7137J3QMW1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm7137J3QMW1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm7137J3QMW1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms