Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms