Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf4bG5E8Z2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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