Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubgcp6G5E8P0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms