Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r12G5E8G1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms