Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r67G5E8C1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms