Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms