Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnmal2G3X9N3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pnmal2G3X9N3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnmal2G3X9N3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms