Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms