Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd3G3X8R9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms