Protein–RNA interactions for Protein: F8VQH7

Dbx2, Developing brain homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx2F8VQH7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx2F8VQH7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Dbx2F8VQH7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx2F8VQH7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms