Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms