Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17093F6XGJ4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms