Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SmgcF6VRN1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmgcF6VRN1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms